METHOD DEVELOPMENT / VERSION 0.1

磁珠核酸提取
不是一瓶化学通吃。

第一代共用硬件优先从 0.8–1.2 µm、单分散、超顺磁、Si–OH / 类硅表面起步；血浆和尿液围绕短片段回收曲线优化，FFPE DNA 围绕裂解与交联逆转，FFPE RNA 围绕限时去修饰、DNase 与短 RNA 保存。

进入四类样本方案先看结论与边界

公开事实 1 µm MyOne SILANE 的规格与 MagMAX 公开应用见 Thermo 说明书与 MagMAX cfDNA 手册。

COMMON MAGNETIC DECK 0.8–1.2 µm Si–OH

P
血浆 cfDNA50–1,000 bp 回收曲线
U
尿液 cfDNA总 cfDNA ≠ 20–40 bp 全回收
D
FFPE DNA脱蜡 → 裂解 → 逆交联 → 纯化
R
FFPE RNA80°C / 15 min 是限时窗口

25 / 40 / 70 / 100 / 150 / 166 / 300 / 500 / 1,000 bp
同拷贝 ssDNA + dsDNA spike-in，逐长度报告绝对回收率

STOP / SAFETY

先把危险组合从实验台上拿走

胍盐废液严禁混入漂白剂、次氯酸盐或强酸。
二甲苯、乙醇、IPA 易燃或有害；通风橱内操作并远离热源。
人血浆、尿液、组织按潜在生物危害样本处理；遵守 SDS、PPE 与机构危废制度。

DECISION FRAME

结论很明确，证据边界也必须明确

本页把“公开披露”与“我们的实验起点”分开。没有配对实验数据的地方，一律不写成性能承诺。

公开事实论文、官方手册或公开实例直接支持候选推断由公开机制组合出的首轮实验条件，需验证工程门槛内部淘汰线，不是通用放行标准专利初筛代表性景观，不替代逐国 claim chart

共用的是硬件，不是化学

先锁定 0.8–1.2 µm Si–OH 共用平台；300–500 nm Si–OH 是超短片段比较臂，约 1 µm COOH 是 SPRI 清洁/尺寸调节臂。

把片段偏倚变成主响应

不能只看总 ng 或 NanoDrop。每个候选都要以等拷贝多长度 spike-in 测绝对回收，并把 ssDNA、dsDNA 分开。

商业套装是性能标尺

血浆/尿液至少对照 MagMAX 与 QIAamp；FFPE 至少对照 MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 或 Maxwell XtractAll。

FTO 必须晚于配方冻结

先在公共基础空间内做单次结合研究；配方、顺序、pH、浓度、珠表面和目标市场冻结后，再逐项做 claim chart。

FOUR PROTOCOL LANES

四类样本，四张可验证实验单

选择一个样本查看目标片段、首发配方、备选臂、步骤、关键 DoE 与 QC 门槛。所有配方均为 RUO 起点。

P / PLASMA

人血浆 cfDNA：先守住 166 bp，再向 50–80 bp 推进

常规双链 cfDNA 主峰约 166–167 bp，但 50–120 bp 亚核小体片段存在，且 ctDNA/胎源 DNA 可能偏短。提取法本身会改变片段谱；“磁珠”不等于天然高回收。

公开事实 Snyder 2016 · Underhill 2016 · 方法比较 · 荷兰环试

目标片段: 50–1,000 bp 分长度；主锚点 166 bp
主力磁珠: 0.8–1.2 µm Si–OH，首发 0.8 mg/mL 血浆
首发化学: GuHCl + IPA，单次结合
商业对照: MagMAX cfDNA / QIAamp circulating NA

前处理基线

全血 2,000×g 10 min、4°C；转移血浆后 16,000×g 10 min、4°C。普通 EDTA 管尽快分离。来源：MagMAX 官方手册。

候选推断

P1 / GuHCl–SiOH 单次结合

P1｜按 1.0 mL K2EDTA 血浆
释放：15 µL Proteinase K（20 mg/mL）+ 50 µL 20% SDS
孵育：60°C 20 min；冰上 5 min
结合：1.50 mL 6 M GuHCl / 50 mM MES pH 5.5 / 0.5% Tween-20
      + 1.20 mL 无水 IPA
      + 20 µL 40 mg/mL SiOH 磁珠
终态：约 2.38 M GuHCl / 31.7% IPA / 0.20% Tween / 0.26% SDS
      0.8 mg 磁珠；20–25°C 强混 10 min
洗 1：1 mL 1 M GuHCl / 50 mM MES pH 6 / 30% IPA / 0.1% Tween
洗 2：80% EtOH × 2
干燥：磁架 3–5 min，仅到无可见液滴，勿过干
洗脱：50 µL 10 mM Tris pH 8.5 / 0.05–0.1 mM EDTA
      56–60°C 10 min

PK/SDS 释放步骤来自 MagMAX 公开手册；组合后的自配结合体系不是 Thermo 配方，尚无本实验室性能数据。

01双离心控 gDNA 污染

02PK / SDS60°C · 20 min

03胍 / 醇 / 珠单次结合 10 min

04胍洗 + 醇洗防抑制物残留

05温洗脱50 µL · 56–60°C

关键 DoE

因子	水平	主响应
GuHCl	2.0 / 2.8 / 3.5 M	50–166 bp 回收、盐残留
IPA	25 / 35 / 45%	超短回收、抑制、专利风险
珠量	0.4 / 0.8 / 1.6 mg/mL	回收、磁清、残珠
pH	5.2 / 6.0 / 7.0	结合曲线、共纯化

工程门槛首轮淘汰线

166 bp 中位回收≥70%
50–80 bp 回收≥50%
inhibition spikeΔCq≤0.5
批内 / 批间 CV≤15%
近 LoD CV≤25%
>1 kb gDNA 比例≤10–20%

NGS 文库产量和低 VAF 检出须不劣于商业对照；以上不是临床放行标准。

U / URINE

尿液 cfDNA：先定义“总 cfDNA”还是“经肾超短 cfDNA”

泌尿道来源 cfDNA 常含 100–300 bp 及更大片段；经肾 cfDNA 可集中于 20–40 bp。两者不能用同一阈值声称“全回收”。

公开事实尿液短 cfDNA 方法比较 · JCI Insight 2024

目标片段: 主线 50–300 bp；探索 20–40 nt/bp
主力磁珠: 约 1 µm Si–OH；300–500 nm 仅作超短臂
首发化学: GuHCl + IPA，总 cfDNA 单次结合
关键前变量: EDTA、pH、肌酐、细胞、血尿、运输时间

保存策略不能固定成一个数字

快速处理从 10 mM EDTA 起步；延迟运输比较 40 mM + pH 8；100 mM 只作超短片段保存臂并验证 EDTA 携带。依据：10 mM、40 mM + pH 8、100 mM 研究。

候选推断

U1 / GuHCl–1 µm SiOH，总 cfDNA 主线

U1｜按 1.0 mL 已澄清尿液
澄清：16,000×g 10 min，4°C；转移上清
结合液：1.25 mL 5.0 M GuHCl / 50 mM MES pH 5.5 / 0.5% Tween
IPA：0.50 / 1.00 / 1.50 mL 三档
磁珠：15 µL 40 mg/mL、约 1 µm SiOH（0.6 mg / mL 原尿）
对应终态：IPA 约 18 / 31 / 40%
          GuHCl 约 2.26 / 1.91 / 1.66 M
结合：强混 10–20 min
洗涤：沿用 P1 的胍洗 1 次 + 80% EtOH × 2
洗脱：30–50 µL 10 mM Tris pH 8.5 / 低 EDTA

体积比例参考 MagMAX 尿液官方说明，但上述自配化学不是 Thermo 配方。初始只可称“总 cfDNA 主线”。

01目标分层总 cfDNA / 超短

02记录基质pH · 肌酐 · 血尿 · 细胞

03澄清16,000×g · 10 min

04单次结合GuHCl / IPA / SiOH

05分长度判定ss / ds 分开

关键 DoE

因子	水平	主响应
保存 EDTA	10 / 40 / 100 mM	降解、gDNA、Mg²⁺携带
珠径	300–500 nm / 1 µm	25–100 bp 回收、t99
GuSCN	2.5 / 3.2 / 4.0 M	超短回收、团聚
IPA	40 / 50 / 60%	回收、残留、连接酶抑制
珠量	0.8 / 1.6 mg/mL	回收、磁清、成本

工程门槛首轮淘汰线

50–80 bp 回收≥50%
25–40 nt/bpss / ds 分报
抑制判断提取前 / 后 spike
EDTA 携带Mg²⁺滴定确认
归一化原尿 mL + 肌酐

HMW gDNA、血尿和细胞数必须单列；25–40 nt/bp 暂不强设同一回收门槛。

D / FFPE DNA

FFPE DNA：把四个旋钮拆开，不在酸性胍液里做高温

脱蜡、组织裂解、交联逆转、纯化必须独立优化。高温逆转在低盐、pH 8 左右水相完成，冷却后才加入胍/醇。福尔马林损伤不能完全修复，下游应偏向 ≤100–150 bp 扩增子并监测 C>T/G>A。

公开事实 MagMAX FFPE DNA 手册

目标片段: 可扩增 60–300 bp；保留最短受损片段
主力磁珠: 0.8–1.2 µm Si–OH；0.3/0.6/1.0 mg
首发化学: 二甲苯 / PK-SDS / 90°C / GuSCN-IPA
备选对照: HiTE 高 Tris–SPRI

候选推断

D1 / 二甲苯–PK/SDS–SiOH

D1｜按 1–2 张 5–10 µm FFPE 切片、约 100 µL 水相
脱蜡：二甲苯 1 mL × 2；无水 EtOH 1 mL × 2
      37°C 开盖 10 min，去尽残溶剂
裂解：100 µL 50 mM Tris-HCl pH 8.0 / 10 mM EDTA
      / 0.5% SDS / Proteinase K 1 mg/mL
孵育：56°C 2 h；难裂解组织加 overnight 臂
逆交联：90°C 20 / 40 / 60 min DoE；冷却后才结合
结合：+100 µL 4 M GuSCN / 400 mM 柠檬酸钠 pH 7 / 2% Triton
      +100 µL IPA + 0.3 / 0.6 / 1.0 mg SiOH 珠
珠前终态：约 1.33 M GuSCN / 33% IPA
珠量 DoE：各臂须等体积重悬或补同一载液；若直接用 40 mg/mL 珠浆，
      7.5 / 15 / 25 µL 会使终 GuSCN 降至 1.30 / 1.27 / 1.23 M，
      IPA 降至 32.5 / 31.7 / 30.8%，形成共线混杂
洗 1：2 M GuSCN / 200 mM 柠檬酸钠 / 1% Triton / 30% IPA
洗 2：80% EtOH × 2
洗脱：50 µL 10 mM Tris pH 8.5，55°C 10 min

结合框架参考公开磁珠实施例 US20060078923A1；将其组合用于 FFPE 是待验证推断。

01脱蜡二甲苯 / 乙醇

02裂解PK / SDS · 56°C

03逆交联低盐水相 · 90°C

04冷却后结合GuSCN / IPA / SiOH

05可扩增性放行多扩增子 qPCR

关键 DoE

因子	水平	主响应
脱蜡	二甲苯 / 矿物油	残蜡、回收、自动化
PK 裂解	2 h / overnight	释放量、完整性
逆交联	90°C 20 / 40 / 60 min	qPCR、损伤、片段谱
珠量	0.3 / 0.6 / 1.0 mg	回收、抑制、残珠
SPRI ratio	0.8× / 1.2× / 1.8×	最短片段保留

工程门槛首轮淘汰线

总量 vs 商业对照≥80%
qPCR vs 对照不差于 1 Cq
重复 CV≤20%
结构 QCDIN + 60/129/200/300 bp
测序 QC重复率 / on-target / C>T

相邻连续切片、按组织面积归一化；商业对照至少 MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 或 Maxwell XtractAll。

R / FFPE RNA

FFPE RNA：80°C / 15 min 是窗口，不是越热越好

RIN 对 FFPE 解释力有限。主判据应是 DV200、短 RT-qPCR、−RT、外源 spike 与 RNA-seq 偏倚。QIAGEN 公开手册明确：RNA 上清 80°C 15 min 可部分逆转修饰，延长或升温会进一步碎裂。

公开事实 QIAGEN AllPrep 手册

目标片段: 短 RNA 主导；DV200 + 60/100/150 bp RT-qPCR
主力磁珠: 0.8–1.2 µm Si–OH；0.3/0.6/1.0 mg
首发化学: PK/SDS → 限时热 → GuSCN/IPA
关键风险: DNase 反应液中 RNA 离珠与水解

候选推断

R1 / PK–限时热–SiOH–DNase / 再结合

R1｜FFPE RNA 首发路线
脱蜡：二甲苯 / 无水 EtOH；去尽残溶剂
裂解：150 µL 20 mM Tris-HCl pH 7.5–8.0 / 1 mM EDTA
      / 1% SDS / Proteinase K 1 mg/mL
孵育：65°C 2 h；20,000×g 5 min 澄清
去修饰：RNA 上清 80°C 严格 15 min；立即冷却
初结合：每 150 µL 上清 + 150 µL 4 M GuSCN
        / 400 mM 柠檬酸钠 / 2% Triton
        + 300 µL IPA（珠前终 1 M GuSCN / 50% IPA）
小 RNA 臂：上述 300 µL 水相改加 700 µL 无水 EtOH（珠前终 70%）
磁珠：0.3 / 0.6 / 1.0 mg SiOH；珠量 DoE 须等体积重悬
洗涤：胍 / 醇洗 1 次；70–80% EtOH × 2
珠上 DNase：100 µL 10 mM Tris pH 7.5 / 2.5 mM MgCl₂
        / 0.5 mM CaCl₂ / DNase I 0.4 U/µL；37°C 10 / 15 min
关键：DNase 反应液不可丢弃；立即胍 / 醇淬灭并再结合
再结合母液：4 M GuSCN / 400 mM 柠檬酸钠 / 2% Triton / 2 mM DTT
40% IPA 臂：100 µL DNase 液 + 75 µL 母液 + 120 µL IPA
             终约 1.02 M GuSCN / 40.7% IPA
50% IPA 臂：100 µL DNase 液 + 100 µL 母液 + 200 µL IPA
             终 1 M GuSCN / 50% IPA
残余 Mg²⁺ / Ca²⁺：40% 臂约 0.85 / 0.17 mM；50% 臂约 0.63 / 0.13 mM
洗脱：EtOH 洗 2 次；30–50 µL RNase-free water

珠上 DNase 的 Mg²⁺/37°C 同时带来 RNA 水解与离珠风险；“保留完整反应液并立即再结合”是关键假设，必须与溶液内 DNase / 二次硅珠纯化对照。

01脱蜡 / 裂解PK / SDS · 65°C

02澄清20,000×g · 5 min

03严格 15 min80°C 后立即冷却

04SiOH 捕获GuSCN / IPA

05DNase / 再结合反应液不可丢

关键 DoE

因子	水平	主响应
裂解路线	PK/SDS / GuSCN-DTT	释放量、DV200
去修饰	80°C 15 min / 70°C 30 min	短 RT-qPCR、碎裂
结合醇	IPA 50% / EtOH 70%	小 RNA 保留、抑制
珠量	0.3 / 0.6 / 1.0 mg	回收、残珠
DNase	10 / 15 min；珠上 / 液相	−RT、RNA 损失

工程门槛首轮淘汰线

总量 vs 商业对照≥80%
RT-qPCR vs 对照不差于 1 Cq
DV200不低于 10 个百分点
−RT晚 ≥8–10 Cq / ND
重复 CV≤20%

同时观察 RNA-seq 比对率、外显子率、rRNA、检出基因数与 3′ 偏倚；RIN 不是核心放行指标。

BEAD SELECTION

磁珠不是“尺寸越小越灵敏”

首轮比较必须按干重、比表面积和真实基质中的磁清时间归一，而不是按珠液体积。300–500 nm 先于 150–250 nm，1 µm 是自动化折中点。

表面 / 粒径	第一用途	优势	主要失效模式	首轮位置
Si–OH / 类硅 0.8–1.2 µm	四类样本的共用纯化平台	重悬、表面积、磁清、自动化较平衡；官方 1 µm 基准充足	不同硅表面不可直接迁移缓冲；胍/醇残留；磁珠 carryover	主力
Si–OH 300–500 nm	血浆/尿液超短片段比较	比表面积更高，可能改善低拷贝短片段捕获	高胍/高醇团聚、磁清慢、珠损失、连接酶抑制	探索
Si–OH 150–250 nm	只在 300–500 nm 显示不足后推进	更高表面积	板式磁清与残珠风险更高，来料表征要求更严	后置
COOH / SPRI 约 1 µm	二次清洁、片段窗口、HiTE 对照	PEG/盐化学成熟，可通过 ratio 调节	原始血浆蛋白/脂质共沉淀；最短片段丢失；PEG 残留	对照
季铵 / 阴离子交换	尿液超短 cfDNA 性能参考	在公开研究中可处理超短片段	盐洗脱与抑制；在权专利密集；非特异杂质	非首代

来料放行必须回答 8 个问题

粒径D10 / D50 / D90、CV / PDI，不能只接受标称值
表面zeta–pH、Si–OH / COOH 密度、比表面积
磁学磁性材料分数、真实板/管与真实化学中的 t90 / t99
低输入25–1,000 bp 等拷贝 ss / ds 绝对回收
杂质RNase / DNase、背景 DNA、铁 / 硅浸出、保存剂
下游PCR、ddPCR、连接酶与文库抑制
自动化沉降、重悬、起泡、挂壁、孔间交叉污染
供应3 批一致性、CoA、变更通知、MOQ、OEM / IVD 权利

DESIGN OF EXPERIMENTS

让第一轮就能淘汰坏方向

Definitive screening 或 D-optimal 先筛主效应；进入真实样本前，先让“长度回收、抑制、磁清、残珠”同时进入响应面。

PHASE 0

珠与基质表征

固含、粒径、zeta、t99、背景核酸；尿液记录 pH/肌酐/血尿，FFPE 记录组织面积/固定史。

PHASE 1

筛选设计

珠面、粒径、珠量、胍盐、IPA、pH、时间；FFPE 另加脱蜡、PK、热窗口、DNase。

PHASE 2

稳健性

每条件 ≥3 技术重复；3 批磁珠、3 天 / 操作者 / 仪器，观察交互与边界失败。

PHASE 3

真实样本确认

配对商业套装，真实个体基质 ≥20 例；按预设淘汰线判定，不事后移动门槛。

每一轮都不能缺的对照

非人源等拷贝多长度 ss + ds spike
提取前 / 提取后 spike
提取空白 / 试剂空白
高低样本交错孔
商业套装对照
无珠 / 无 PK / 无高温对照

统一响应矩阵

R1分长度绝对回收25–1,000 bp；ss / ds

R2抑制ΔCq、Mg²⁺滴定、连接酶

R3污染HMW gDNA、−RT、空白

R4磁学t90 / t99、残珠、重悬

R5下游文库产量、on-target、偏倚

R6稳健性批 / 日 / 人 / 机 CV

PATENT LANDSCAPE / FIRST PASS

基础原理已进入公共空间，现代组合仍然拥挤

“Boom / SPRI 过期”不等于从原始血浆或尿液做特定尺寸分级、从 FFPE 做特定一锅化学就没有风险。

专利初筛

相对稳妥的研发起点

普通 Si–OH 珠 + 胍盐 + 醇，单次结合。
经典 COOH 珠 + PEG8000 + NaCl，用于二次清洁。
传统二甲苯 / 醇脱蜡 + PK + 水相加热 + 通用硅珠纯化。
纯化和尺寸选择拆开，先追求全回收。

专利初筛

优先避开精确复制

酸性阴离子交换 + 聚氧乙烯醚特定组合。
以 pH / GuSCN 精确设定硅质 cutoff。
原始血浆两阶段、低醇、硅质同步纯化 / 分级。
特定含水胺一锅式 FFPE 或特定矿物油 + PEG / 盐全流程。

1989–1997

基础公共空间

EP0389063B1：Boom 硅质固相 + 胍盐。
US5705628A：经典 SPRI。
US6027945A：硅磁粒通用纯化。

基础已到期

PLASMA / URINE

片段 cutoff 与流程拓扑

US10184145B2 / CN107690481B
US9624252B2 / US10745686B2
US12398389B2 家族

重点监控

URINE / CN

保存、低 / 高醇与磁粒组合

US20220396785A1
CN118256489B · CN110283818A · CN111902545B

逐国核查

FFPE

差异释放、一锅化学与脱蜡

US9422542B2 · US9416356B2
EP3269813B1
US10274405B2 · CN111593047B

重点监控

边界：Google Patents 的状态不是法律结论。商业化前应按目标销售国、最终组分、操作顺序、pH、浓度、磁珠表面和宣称用途，由专利专业人士完成同族法律状态核验与逐项 claim chart。

SUPPLY / PROCUREMENT

先把“采购来源”和“潜在客户”拆开

这里推荐的是可进入技术筛选的供应来源与公开业务匹配对象，不代表背书、实际采购关系或合作意愿。

最可能的含义

“买家”＝卖家 / 采购来源

看粒径、表面、固含、批间、磁清、核酸背景、OEM 与变更通知。

若确指商业客户

“买家”＝潜在使用者

只能按公开技术能力做 BD 初筛，不能据此声称其外购磁珠或有采购意愿。

中国优先短名单

全球基准 / OEM

商业流程对照 MagMAX cfDNA QIAamp circulating NA MagMAX FFPE Ultra Maxwell XtractAll

若“买家”确指潜在客户：仅作公开匹配线索

燃石医学、金域医学、艾迪康、天隆、Natera Signatera、Labcorp FFPE NGS 的公开业务与场景匹配，但不证明其外购、采购意愿或既有合作关系。

INDEPENDENT REVIEW

Claude 独立审阅，Codex 以证据和可验证性裁决

一致意见进入方案；分歧不“平均”，而是转化成 DoE 或保留有公开基准的一侧。

一致意见

高醇比例与表面积可能决定超短片段回收；FFPE RNA 的 80°C / 15 min 必须限时；珠上 DNase 的 Mg²⁺ / 37°C 是风险点；SPRI 更适合硅珠后的二次清洁或尺寸调节。

1 µm 是否应做首选？

Claude

不应把 1 µm 设为首选，珠量倾向 1.5–3 mg/mL。

Codex 裁决

依据 MyOne / MagMAX 公开实践，保留 1 µm、0.4–1.6 mg/mL 作为首轮基线；同时加入 300–500 nm 与更高珠量臂。

尿液 EDTA 设多少？

Claude

倾向 EDTA ≤10 mM。

Codex 裁决

公开研究分别支持 10 / 40 / 100 mM，不设单值；以运输时间、pH、目标片段与下游 Mg²⁺功能测试裁决。

是否固定高醇？

Claude

倾向固定高醇以提高超短片段回收。

Codex 裁决

把醇比例设为主 DoE；高醇可能改善超短回收，也会增加抑制、团聚与活跃专利风险。

SOURCE DESK

来源检索台

筛选原始论文、官方手册、专利与供应商页。关键结论已在正文就近链接，这里便于集中复核。

0 条来源可见

官方手册Dynabeads MyOne SILANE 产品说明1 µm、CV≤5%、40 mg/mL、约 20 m²/g 官方手册MagMAX Cell-Free DNA User Guide血浆/血清公开流程与 MyOne SILANE 技术官方手册MagMAX Cell-Free DNA：尿液说明体积比例与尿液应用参考官方手册QIAGEN AllPrep DNA/RNA FFPE HandbookRNA 80°C / 15 min 限时窗口官方手册MagMAX FFPE DNA Isolation User GuideFFPE DNA 流程与损伤背景论文Snyder et al., 2016血浆 cfDNA 核小体片段图谱论文Underhill et al., 2016ctDNA 片段长度差异论文血浆 cfDNA 提取方法比较方法会改变产量与片段谱论文cfDNA 荷兰环试跨方法标准化与回收差异论文尿液短 cfDNA 方法比较短片段回收与阴离子交换参考论文JCI Insight 2024经肾超短 cfDNA 与保存研究论文尿液 cfDNA：10 mM EDTA / 冷冻研究保存条件证据之一论文尿液 cfDNA：40 mM EDTA + pH 8延迟处理保存条件证据之一论文HiTE：FFPE DNA 高 Tris 提取矿物油、高 Tris 与 SPRI 公开路线论文ht-HiTE 2025高通量 FFPE DNA 公开评价论文DeAngelis et al., 1995经典 SPRI 原始论文专利EP0389063B1Boom 硅质固相 + 胍盐基础专利US5705628A经典 SPRI 公共基础专利US6027945A硅磁粒通用核酸纯化专利CN107690481B酸性阴离子交换 / 聚氧乙烯醚体系专利US12398389B2 家族原始血浆两阶段低醇硅质分级专利US20220396785A1尿液低 / 高醇顺序尺寸捕获专利US9416356B2特定含水胺 / 胍 / 溶剂一锅式 FFPE 专利US10274405B2特定脱蜡分层流程供应商BeaverBio 海狸国内多档 SiOH / COOH 磁珠供应商Nanoeast 东纳200 nm / 1 µm SiOH 与 cfDNA 应用供应商Magen 美基约 0.8 µm Si 表面珠供应商Cytiva Sera-Mag SpeedBeads COOH全球 SPRI 原料基准供应商Promega MagneSil全球硅质顺磁粒子基准

BEFORE THE FIRST RUN

这是一张实验起跑图，不是现成试剂盒说明书。

所有候选配方和工程门槛均需实验验证；没有数据的方向已标注“需验证”。进入 IVD 需要 ISO 13485 设计控制、分析性能、稳定性、运输、自动化验证与各市场注册。不得把内部工程目标改写成临床性能声明。

回到四类样本

磁珠核酸提取不是一瓶化学通吃。

先把危险组合从实验台上拿走

结论很明确，证据边界也必须明确

共用的是硬件，不是化学

把片段偏倚变成主响应

商业套装是性能标尺

FTO 必须晚于配方冻结

四类样本，四张可验证实验单

P1 / GuHCl–SiOH 单次结合

关键 DoE

工程门槛 首轮淘汰线

U1 / GuHCl–1 µm SiOH，总 cfDNA 主线

关键 DoE

工程门槛 首轮淘汰线

D1 / 二甲苯–PK/SDS–SiOH

关键 DoE

工程门槛 首轮淘汰线

R1 / PK–限时热–SiOH–DNase / 再结合

关键 DoE

工程门槛 首轮淘汰线

磁珠不是“尺寸越小越灵敏”

来料放行必须回答 8 个问题

让第一轮就能淘汰坏方向

珠与基质表征

筛选设计

稳健性

真实样本确认

每一轮都不能缺的对照

统一响应矩阵

基础原理已进入公共空间，现代组合仍然拥挤

相对稳妥的研发起点

优先避开精确复制

基础公共空间

片段 cutoff 与流程拓扑

保存、低 / 高醇与磁粒组合

差异释放、一锅化学与脱蜡

先把“采购来源”和“潜在客户”拆开

“买家”＝卖家 / 采购来源

“买家”＝潜在使用者

若“买家”确指潜在客户：仅作公开匹配线索

Claude 独立审阅，Codex 以证据和可验证性裁决

1 µm 是否应做首选？

尿液 EDTA 设多少？

是否固定高醇？

来源检索台

这是一张实验起跑图，不是现成试剂盒说明书。

磁珠核酸提取
不是一瓶化学通吃。

工程门槛首轮淘汰线

工程门槛首轮淘汰线

工程门槛首轮淘汰线

工程门槛首轮淘汰线